单细胞ATAC-seq(Aaasay for transposase Accessible Chromatin with high throughput sequencing at the single cell level) 是指在单细胞水平上检测开放染色质的方法。其原理为基于Tn5转座酶对片段化
。(Schematics of RNA-Seq workflow. Wang Y et al., Bioinformatics. 2011)麦特绘谱可提供的技术服务:1)真核有参转录组测序真核生物转录组测序可以分为有参和
ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究新策略
简介:染色质分为常染色质和异染色质,而常染色质处于松散的开放状态,允许反式作用因子结合顺式调控元件,进而调控基因表达。ATAC-seq 利用tn5 酶
ATAC-Seq由于所需细胞量少,实验简单,可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态,目前已经成为研究染色质开放性的首选技术方法。
转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。这些开放的区域代表基因组上的转录活跃区域。 单细胞ATAC-seq基于转座酶介导的测序引物插入开放的染色质区域。像普通的
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