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MicroRNA Target Pathway Network-microrna target pathway network
根据差异MicroRNA和被调控靶基因的显著性通路,利用MicroRNA和靶基因通路的属性,构建MicroRNA Target Pathway Network。该网络反映目标MicroRNA对
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microRNA-pathway-network
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Pathway Network-pathway network
信号通路作用网络——Pathway Network 根据KEGG数据库中的Pathway间的相互作用关系,构建差异基因参加的显著性Pathway之间的作用网络,确定显著性
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lncRNA Target Pathway Network-lncrna target pathway network
lncRNA对信号通路的调控网络—— lncRNA Target Pathway Network 根据差异lncRNA和被调控靶基因的显著性通路,利用lncRNA和靶基因通路的属性,构建
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MicroRNA Target Gene Network-microrna target gene network
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MicroRNA Target GO Network-microrna target go network
Target GO Network和MicroRNA Target Pathway Network,通过三种分析工具定位出核心miRNA-384-5p及靶标PIK3CD , 且该miRNA参与凋亡相关
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microRNA-GO-network
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microRNA-pathway-network
的关系,利用图论计算出 microRNA 最相关通路,以及大部分 microRNA 与哪些通路最相关。microRNA-pathway-network对筛选出的核心靶基因进行 pathway 富集分析
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MicroRNA qPCR检测
免费设计优化引物,使定量PCR反应扩增效率达到90%以上,使相对定量结果更可靠。利用加尾法对RNA进行逆转录,可以从一个反应合成的cDNA中同时检测多种miRNA,节约样品的同时实现检测的高通量。
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TF Network-tf network
转录因子调控网络——TF Network 根据差异mRNA、miRNA和lncRNA,通过Tansfac数据库预测其前体的转录因子,并将预测的转录因子与mRNA、miRNA和lncRNA
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