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16S/18S/ITS扩增子测序
微生物群落多样性分析是指利用二代高通量测序技术,对微生物的16S rDNA、18S rDNA、ITS以及目标区域扩增子测序
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Digital-16S rDNA测序/绝对定量16S
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RPS7/40S ribosomal protein S7
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16S/18S/ITS扩增子测序
检测其中的一段或几段区域,可以了解环境样品中细菌的分类和丰度。应用领域:1. 癌症基因测序2. 植物和动物测序3. 疾病筛查
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16S/18S/ITS扩增子测序
、标准信息分析 1)数据处理 去除低质量及含有接头(adapter)、读N碱基等的reads 产出数据及质控统计 Paired-end reads拼接为tags 去除引物序列 2
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16S/18S/ITS扩增子测序
选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
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微生物16S/18S/ITS测序
测序:ITS 分为两个区域:ITS1/ITS2,其中 ITS1 位于真核生物核糖体 rDNA 序列 18S 和 5.8S 之间,ITS2 位于真核生物核糖体 rDNA 序列 5.8S 和 28S 之间
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微生物16S/18S/ITS测序
测序:ITS 分为两个区域:ITS1/ITS2,其中 ITS1 位于真核生物核糖体 rDNA 序列 18S 和 5.8S 之间,ITS2 位于真核生物核糖体 rDNA 序列 5.8S 和 28S 之间
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16S rDNA 测序
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16S rDNA测序
两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。实验流程图:样本要求:Total RNA 10µg案例展示:1、各样品组的物种相对丰度柱状图Alpha
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