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非模式生物基因功能注释
/KOG注释:COG是 KOG 通过Uniprot的注释结果, 得到COG和KOG的注释功能归类。基因相互关系网络注释:利用STRINGS蛋白质相互关系网络, 根据COG/KOG与COG/KOG
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RSAM-09 长非编码RNA研究:lncRNA-protein相互作用分析
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App Chip-06 基因调控网络预测
出调控关系网络。 http://www.biogenius.cn/htm/solution/Biochip/79.html 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计
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IPA基因作用通路分析
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App TRAN002 基于比较基因组学方法重构转录调控网络
可信度,并选择参与调控的Motif处于保守序列上,也就是说TF对应的结合Motif序列的保守性得分不低于阈值范围zei终筛选出调控关系网络。 更多详情:http
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lncRNA相关研究整体思路
门的要数 ceRNA 调控网络。相关的可利用资源包括: (1)starBase 平台构建了最全面的 CLIP-Seq 实验支持的 miRNA 和 lncRNA 的调控关系网络,包括构建
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表达谱芯片数据分析,microRNA,-seq,LncRNA,DNA甲基化,SNP
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