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使用CUT&Tag实现转录因子结合位点精确定位的方法详解
在表观遗传学研究中,精确定位转录因子结合位点是揭示基因调控网络的关键环节。尽管ChIP-seq已成为该领域的经典方法,但它存在样本需求高、背景噪音大等局限。近年来,Cleavage Under Targets and Tagmentation(CUT&Tag)技术因其高灵敏度、低起始细胞量和单碱基分
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转录因子活性谱芯片服务
一个转录因子可调控数百个基因的表达,而一个基因的表达又可受数个转录因子的调控从而形成复杂的调控网络。转录因子的结构和功能缺陷与人类的一些疾病(如肿瘤和炎症)相关,许多转录因子还是药物作用的靶点。
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人转录因子相关基因cDNA芯片
人转录因子cDNA芯片有助于认识转录因子与转录因子、转录因子与辅激活和/或抑制因子以及转录因子与DNA之间构成的复杂调控网络;而且还可能通过针对性的设计和筛选,开发出更专一、更有效的治疗药物及治疗方法。
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microRNA转录因子等预测分析
TF预测方案及结果 转录因子数据库使用TRANSFAC 7.0 public。转录因子结合位点预测使用pwmatch程序,设置log-odds的cutoff值。
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CSAM-08:转录因子-靶基因关联分析
CSAM-08:转录因子-靶基因关联分析 本方案是根据转录因子结合位点( TFBS )与转录起始位点( TSS )之间的距离来定量估计转录因子( TF )与靶基因基因的关联调控强度,即预测调控关系强度
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转录因子PCR芯片Transcription Factors PCR Array
转录因子PCR芯片 Transcription Factors PCR Array转录因子PCR芯片可以同时检测84关键转录因子的表达情况。
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App TRAN001 基于转录因子结合位点数据重构转录调控网络
App TRAN001 基于转录因子结合位点数据重构转录调控网络 基于二代测序技术,研究者可以根据研究需要针对单一或多个转录因子同时进行转录因子在靶基因调控序列上的结合位点分析。
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转录因子分析及网络构建
找到差异的转录因子及其调控的靶基因,我们可以构建 TF-network,从中得出关键的转录因子及被关键转录因子转录调控的基因,系统的研究转录因子与基因的调控关系。
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CSAM-06:ChIP-Seq 转录因子结合位点的基序分析
对于调控 DNA转录的蛋白因子而言,每个转录因子可能会发现一组不同的结合序列 motif ;通过不同转录因子的motif 分析,可能会发现转录因子共调控的 TFBS 特征。
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microRNA分析服务(转录因子、靶基因、三维结构预测)
项目一:microRNA 转录因子预测分析 提取启动子序列 针对目标microRNA,提取TSS上游5000bp序列和下游500bp序列作为转录因子(TF)预测的数据。
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