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DCAM-08:差异化甲基化位点临近基因生物学功能注释
analysis)。根据超几何分布计算差异基因参与的生物学功能类别以及生物学通路。 图例:GO 富集度分析(GO enrichment analysis) 更多详情:http
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mRNA solexa测序分析服务
。计算每个节点的基因数目,并结合整个数据库的基因作为背景分部,对于每个节点,得到一个2x2 的表格,使用超几何分布检验基因在每个GO 节点的富集或贫乏程度。 三、Pathway 分析 与GO
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DCAM-07:差异化甲基化位点临近基因生物通路分析
的生物学通路进行综合分析,考察DNA甲基化变异对pathway的影响程度和影响的规律。通过GSEA(配合芯片表达谱数据),KS检验,超几何分布检验等方法对变异基因在某些pathway的富集程度进行排序
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通路的显著性分析——Pathway Enrichment Analysis-潜在通路分析
目前,KEGG是有关Pathway的主要公共数据库。根据挑选出的差异基因,计算这些差异基因同Pathway 的超几何分布关系,Pathway 分析会对每个有差异基因存在的pathway 返回一个
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App Pro-06 蛋白质信号通路与功能
分析,可以考察功能性变化对生物通路的影响。通过GSEA检验(需表达谱数据),KS检验,和超几何分布检验等方法对研究蛋白在某些通路的富集程度进行排序,识别发生功能改变的潜在通路
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GRSAM-20 生物学通路分析
基因映射到生物学通路中进行系统化分析,考察功能性突变对生物通路的影响。通过GSEA检验(需表达谱数据),KS检验,和超几何分布检验等方法对变异基因在某些通路的富集程度进行排序,识别发生功能改变的潜在
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SSAM-05 microRNA-靶基因调控网络分析
芯片表达谱数据),KS检验,超几何分布检验等方法对变异基因在某些pathway的富集程度进行排序,识别发生功能改变的潜在通路。我们已经对目前所有信号通路资源进行整合优化,并适用于研究的个性化
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“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术
表格,使用超几何分布检验基因在每个GO节点的富集或贫乏程度。 Pathway enrichment分析 找出差异表达基因在生物学通路中的位置,以阐明其生物学功能以及不同基因之间的相互作用。 1
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