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染色质免疫共沉淀技术测序(chip-seq 组蛋白 转录因子
结果进行图像识别( Base calling ),去除污染及接头序列;统计结果包括:测定的序列( Reads )长度、 Reads 数量、数据产量。 高级分析 1)ChIP-Seq 序列与参考
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CHIP测序
calling),去除污染及接头序列;统计结果包括:测定的序列(Reads)长度、 Reads 数量、数据产量 2. 高级信息分析 a)ChIP-Seq 序列与参考序列比对; b)Peak
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单细胞ATAC测序服务(single cell ATAC sequencing
进行分群并鉴定细胞类型,TF-motif鉴定和富集程度分析,Peak相关基因分析及差异可及性位点分析。其中包括:1)预处理(质量控制(QC)和比对);2)基本分析(peak calling、聚类
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全基因组甲基化测序
测序数据进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估; b)去接头污染,去低质量reads和产量情况统计 c)Bisulfite 测序序列与参考基因组序列的
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MeDIP测序
模式的差异; DMRs(甲基化差异区域)的研究。 分析内容 1. 标准信息分析 对测序结果进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估 2. 高级信息分析
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TargetSeq-03 人类全外显子组测序
and SNP calling)变异体的质量得分矫正(quality score recalibration)2 突变体注释分析突变体注释:1000G database, dbSNP, COSMIC
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Chip-seq实验
实验步骤,实验数据及生物信息学分析包括测序数据质量评估,与参考基因组比对,peak峰calling,motif分析,peak峰相关基因注释,差异peak分析,相关基因GO,KEGG富集分析等;参考文献
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目标区域捕获测序
目标区域测序(Targeted Resequencing)针对靶基因序列进行探针设计、区域捕获、双端测序和信息分析。其优势是集中区域,小数据量,较低成本,大深度和高覆盖度。
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外显子测序
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真核生物转录组测序分析(RNA-seq
分析;7.差异基因的功能富集分析;8.差异基因层次聚类分析;9.SNP Calling; 10.SSR开发11.差异基因蛋白互作网络分析
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