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App NGS RNA测序-真核/原核转录组测序服务
)。BioGenius提供2×100bp读长,有参考基因组测序主要有2Gb、4Gb、8Gb clean data三种数据类型,无参考基因组测序主要有4Gb、8Gb、10Gb三种数据类型的HiSeq
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App NGS RNA结合蛋白富集测序 RIP-Seq/CLIP-Seq服务
,去除PCR duplication reads,得到clean reads。2.基因组和转录组比对将clean reads比对到基因组,将不能比到基因组的reads比到转录组,筛选出唯一比上的
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RNA结合蛋白富集测序 RIP-Seq/CLIP-Seq服务
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SSAM-01 microRNA 高通量测序数据分析
拼接Scaffold内,正负链,比配的clean reads总数目;将sRNA比对到mRNA的内含子和外显子,找出来自mRNA降解片段的sRNA。 miRBase数据库比对
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宏基因组测序
可靠,首先要对原始数据进行质控及宿主过滤,得到有效数据(Clean Data); b) Metagenome 组装:从各样品质控后的 Clean Data 出发,进行 Metagenome 组装
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美国Hausser McMaster Egg Slide计数板
, this is the eggs per gram(EPG).To clean the counting chamber: After completing the count, remove
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ChIP-seq
首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建,然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序
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表达谱测序
疾病分类研究 分析内容 1. 标准信息分析 a)对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 tags 的处理 b)测序评估(数据比对统计,测序饱和度分析,Clean tag拷贝数
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微生物Meta测序
日 注:分批送样时间延长,样本量大时间有延长几个工作日。 完成标准:对每个样品,产生不低于合同规定的Clean tags数量和Clean data数据量。
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数字化基因表达谱测序
本、基因组表达调控区域等。 数据分析 基因的表达量统计 统计每个基因对应的原始Clean tag数,并对每个基因原始Clean tag数做标准化处理,便于准确比较样本间基因表达差异 差异基因挑选
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