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eQTL表达数量性状定位分析
染色体上一些能特定调控mRNA和蛋白质表达水平的区域,其mRNA/蛋白质的表达水平与数量性状成比例关系。其具体原理是把基因表达量作为一种数量性状,研究遗传突变与基因表达的相关性。
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App CD-01 表达数量性状(eQTL)分析(复杂疾病与性状研究)
App CD-01 表达数量性状(eQTL)分析 将数量性状定位(quantitativetraitloci,QTL)和基因表达谱分析联合运用产生了遗传基因组学或基因表达数量性状定位
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App CD-01 表达数量性状(eQTL)分析
App CD-01 表达数量性状(eQTL)分析 将数量性状定位(quantitativetraitloci,QTL)和基因表达谱分析联合运用产生了遗传基因组学或基因表达数量性状定位
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RSAM-13 基因表达数量性状定位(eQTL)分析
RSAM-13 基因表达数量性状定位(eQTL)分析 将数量性状定位(quantitativetraitloci,QTL)和基因表达谱分析联合运用,产生了遗传基因组学或基因表达数量性状定位
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转录组测序(RNA-seq
• DH群体或F2群体测序1. 构建连锁群2. 直接定位QTL3. eQTL定位4. 表达验证• 多品种群体测序1. GWAS
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目标区域测序
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转录组测序
5. SNP分析和eQTL分析 6. 基因结构优化及优化基因的表达值计算 7. 蛋白互作网络分析 8. 样品间可变剪切和新转录本的比较 9. 新lncRNA的功能分析(五个lncRNA) 10. 组间
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Hi-C三维基因组 Hi-C 测序
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LncRNA测序
(22)lncRNA保守性分析(23)可变剪切3.2 高级分析(1)已知mRNA-lncRNA共表达网络构建(2)基因结构优化及优化基因的表达值计算 (3)eQTL分析4、技术流程5、案例分析
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外泌体lncRNA测序
)lncRNA保守性分析(23)可变剪切3.2 高级分析(1)已知mRNA-lncRNA共表达网络构建(2)基因结构优化及优化基因的表达值计算(3)eQTL分析4、技术流程5、案例分析 案例(1)外
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