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生物信息学分析-GEO数据分析
生物信息学分析--GEO数据分析 高通量微阵列芯片和第二代测序技术的快速发展,产生大量的基因数据,GEO数据库是美国生物技术信息中心(NCBI)的基因表达的综合库,是全球最大的基因芯片
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肿瘤中代谢相关基因特征的构建及预后意义研究
模型的预后能力。基因特征的预后价值在独立的GEO 数据集中得到进一步验证。作者构建了一个具有 13 个代谢基因的基因特征作为独立的预后因素。 Kaplan-Meier 生存分析证明了风险模型在
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股骨头坏死ceRNA分析
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中药网络药理学研究
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TCGA/GEO/SRA/EBI公共数据库高通量数据挖掘分析
利用公共数据库的数据,对 TCGA/GEO/SRA/EBI中疾病相关转录组数据进行深度挖掘,筛选疾病相关 mRNA、lncRNA,并利用临床数据获得预后相关的潜在分子靶标。1、 公共数据获取和重注释
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肿瘤免疫微环境中 m6A 相关特征的分析和肾上临床预后调节因子的鉴定
潜在作用尚不清楚。在本研究中,作者系统地分析了来自TCGA和GEO 数据库的 ACC 样本中的 21 个 m6A 调节因子,确定了三种具有不同临床结果的 m6A 修饰模式,并发现了不同的 m6A 簇与
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诊断模型构建
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CapitalBio aCGH检测
About a Microarray Experiment)规范提供给客户,方便进行GEO等数据提交工作;采用成熟且得到广泛认可的数据分析方法,便于数据分析方法的可接受性;博奥生物开发的分子功能注释
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IPA组学数据挖掘及联合分析
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筛选新肿瘤药靶/biomaker整体解决方案
基于TCGA、GEO大数据或客户样本,筛选未在所研究肿瘤中被报道过功能或临床相关性的新功能基因,对所筛选到的基因进行细胞、体内水平的多种实验验证,并探讨所筛选基因潜在作用机制,为后续抗肿瘤药物的靶点
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