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肿瘤SNPs统计分析
肿瘤SNPs统计分析1 分析目的统计分析肿瘤样本中的体细胞单核苷酸变异(SNPs)信息,对比肿瘤vs正常,挖掘肿瘤样本中的SNPs分布以及基因的突变频率2 数据来源UCSC Xena 数据库中的肿瘤
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SNPs分型系统解决方案
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中zei常见的
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基因组学与蛋白质组学
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BSA性状关联分析
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SNP芯片服务
超过946,000个用于检测拷贝数变化(CNV,Copy Number Variation)的探针:482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片;424,000个SNP包括了源来于
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Affymetrix全基因组SNP芯片检测
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转录组分析
编码基因的聚类分析(热图) l 差异表达基因富集分析(GO、KEGG) l SNPs的分析(SNPs鉴定、同义/非同义突变、与已有SNPs数据库比对) l 可变剪切分析 l UTR区域鉴定 l
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简化基因组测序
质量评估 2. 标记位点分析: l 标记位点鉴定 l SNPs位点鉴定 3. 应用分析: l SNP单体型图谱分析 l 全基因组关联分析(GWAS) l 连锁分析和QTL定位 l
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动植物基因组重测序
动植物基因组重测序 基因组重测序是对已知基因组序列物种的个体进行基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行比较基因组学分析。通过全基因组重测序可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNPs
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微生物基因组重测序
1. 原始数据整理、过滤及质量评估 2. 基因组重测序分析 l 与参考基因组比对(共线性) l 基因组岛鉴定 l SNPs和InDel的检测及在基因组的分布 l CNV和SV的
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