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基于TCGA项目的数据分析
非小细胞肺癌中CDKN2A、MDM2、 MDM4 和TP53 这4个基因的遗传变异信息 1.2 可提供mRNA/lncRNA/miRNA(后期客户筛选)的生存曲线;Demo
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生物信息学分析 TCGA数据库
生物信息学分析--TCGA数据库 生存分析(survival analysis) 将事件的结果和出现这一结果所经历的时间结合起来分析的一类统计分析方法。生存分析资料通常采用纵向随访观察
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TCGA数据挖掘服务| 肿瘤相关表观遗传调控基因深度分析
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TCGA/GEO/SRA/EBI公共数据库高通量数据挖掘分析
利用公共数据库的数据,对 TCGA/GEO/SRA/EBI中疾病相关转录组数据进行深度挖掘,筛选疾病相关 mRNA、lncRNA,并利用临床数据获得预后相关的潜在分子靶标。1、 公共数据获取和重注释
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肿瘤风险分层和生存预后的新型免疫相关基因特征构建
r 背景介绍随着基因表达谱在低级别胶质瘤 (LGG) 中的流行,并且基于免疫微环境的关键作用,本研究的目的是开发用于 LGG 风险分层和预后预测的免疫相关特征。使用TCGA、GTEx和CGGA 的
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生存分析
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肿瘤中代谢相关基因特征的构建及预后意义研究
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肿瘤免疫微环境中 m6A 相关特征的分析和肾上临床预后调节因子的鉴定
潜在作用尚不清楚。在本研究中,作者系统地分析了来自TCGA和GEO 数据库的 ACC 样本中的 21 个 m6A 调节因子,确定了三种具有不同临床结果的 m6A 修饰模式,并发现了不同的 m6A 簇与
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预测癌症患者总体生存率的新型铁死亡相关基因特征构建
研究中,作者从公共数据库下载了 HCC 患者的 mRNA 表达谱和相应的临床数据。使用LASSO-Cox 回归模型在 TCGA 队列中构建多基因特征。来自 ICGC 队列的 HCC 患者用于验证
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疾病标志物研究整体解决方案
协助你从Taylor、TCGA(The Cancer Genome Atlas)等基因芯片数据库中挖掘肿瘤相关基因,其中TCGA数据库包含有临床随访数据的多个病例,如前列腺癌、结直肠癌、胃癌、乳腺癌
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