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比较转录组测序
比较转录组,是结合RNA-seq技术手段研究物种进化的技术手段。通过不同物种或亚种间mRNA序列差异分析近源物种间的亲缘关系,挖掘明显受到正向选择或负向选择的基因。
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泛基因组测序
概述 泛基因组即通过de novo组装策略,构建不同亚种或生态型全基因组序列,从而完善该物种基因集并获得个体特异基因信息。泛基因组包括核心基因组和非必须基因组。运用高通量测序及生物信息分析手段
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泛基因组测序
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转录组测序
(ka/ks)分析(不同遗传背景的亚种或物种) 8)物种进化关系分析(需提供多个物种或者亚种) 9)可变剪切分析(有参考基因组的模式生物) 10)融合基因分析(有参考基因组的模式生物) 11)长链非
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Affymetrix SNP 芯片服务
人类基因组由30亿个核苷酸组成,它们携带着人类的遗传信息并决定人体的生理特征。人类基因组序列的0.1%—0.2%在人种、人群和个体之间存在DNA序列的差异,即单核苷酸多态性(SNP)。
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NTM 测序分析及物种鉴定
) 物种鉴定结果示例: 以95%的相似度为阈值进行分枝杆菌物种判定,同时也可分析出相应的亚种。 2、系统进化树NTM 样本系统进化树示例: 根据相似度矩阵构建系统发育树,分析种间及种内群体多样性
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Affymetrix SNP芯片
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群体进化(重测序
情况、物种形成机制以及群体进化动态等生物学问题,从分子层面深入研究该物种的进化历程。 适用范围 已有参考基因组的物种; 同一物种不同的亚种和品系; 不同地理分布的群体; 每个群体至少10个样本,总样本
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RAD-Seq
应用于遗传图谱的构建,从而为后续的QTL定位奠定基础。 基于RAD-Seq的群体进化分析,对物种的各亚种进行RAD测序获得基因组信息,通过与RAD tag组装出的参考序列或参考基因组序列进行比对,获得
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凯益生物转基因拟南芥遗传转化实验技术服务研发外包
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